1、2015 年，斯坦福大学 William Greenleaf 和 Howard Y Chang 继续发力，通过将 ATAC-seq 结合微流控技术，推出了升级版本单细胞 ATAC-seq（scATAC-seq），文章发表于 Nature。

在 scATAC-seq 中，通过一个程序化的微流控平台捕获单个细胞，随后在一个整合的流体学集成环路（integrated fluidics circuit，IFC）上进行转座酶切和 PCR，回收文库，并通过带有 barcode 的引物进行 PCR 扩增；随后将单细胞的文库混合并进行高通量测序。

图 scATAC-seq实验流程

2、目前单细胞测序最常用的平台为 10x Genomics。2019 年 3 月，嘉因生物单细胞ATAC-seq 通过美国 10x Genomics 公司的 CSP 认证，是 10x Genomics 官方认证的 Chromium Single Cell ATAC Solution 服务商。

作为国内较早开展 ATAC-seq 服务的团队，嘉因生物于 2018 年 8 月 1 日宣布启动“十万样本 ATAC-seq 计划”，该计划受到北京大学李程教授和同济大学江赐忠教授的高度点评。（点击链接，查看此前报道）“十万样本 ATAC-seq 计划”自开展以来，广受好评，积累了丰富的 ATAC-seq 经验。在此基础上，嘉因生物于 2019 年进一步推出了单细胞 ATAC-seq 项目，并通过了 10x Genomics 的 CSP 认证，成为官方认可的 Chromium Single Cell ATAC Solution 服务商，也进一步表明了该公司在开展单细胞 ATAC-seq 服务上的实力。

  表 嘉因生物数据与10X官网数据的详细对比

单细胞 ATAC-seq 实现了单细胞染色质开放性的可视化，单细胞 RNA-seq 实现了单细胞基因表达水平的可视化，二者相结合可在转录水平和转录后水平全面了解基因调控网络。为此，公司还推出单细胞 ATAC-seq 和单细胞 RNA-seq 联合项目，进一步帮助研究人员从单细胞水平深入挖掘基因表达动态调控机制。

自 2019 年 3 月起，嘉因生物正式在全国范围内开展了单细胞 ATAC-seq 和单细胞 RNA-seq 上门服务，样本覆盖了小鼠脾脏组织、小鼠肺脏 T 细胞、人肝癌及癌旁组织、人胎盘组织等等。目前下机的正式项目中，数据质量全部达标，欢迎各位研究人员前来咨询探讨！